Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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EFNB3Q15768 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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EFNB3Q15768 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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EFNB3Q15768 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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EFNB3Q15768 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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EFNB3Q15768 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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