Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TCEA2Q15560 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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