Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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SS18Q15532 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SS18Q15532 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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SS18Q15532 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SS18Q15532 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SS18Q15532 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SS18Q15532 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SS18Q15532 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SS18Q15532 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SS18Q15532 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SS18Q15532 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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