Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BRD3Q15059 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BRD3Q15059 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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