Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NFIXQ14938 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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