Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRCAPQ14761 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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