Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SEMA3AQ14563 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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