Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM25Q14258 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms