Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PKP1Q13835 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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