Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms