Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
FHL3Q13643 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms