Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMAD4Q13485 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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