Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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TOP3AQ13472 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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TOP3AQ13472 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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TOP3AQ13472 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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TOP3AQ13472 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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TOP3AQ13472 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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TOP3AQ13472 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
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