Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA4Q13439 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms