Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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GPS1Q13098 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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GPS1Q13098 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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GPS1Q13098 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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GPS1Q13098 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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GPS1Q13098 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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GPS1Q13098 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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GPS1Q13098 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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