Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF1Q13077 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms