Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GRIK2Q13002 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms