Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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NFX1Q12986 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFX1Q12986 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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