Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBRQ0VD83 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms