Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
KRTAP1-1Q07627 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
KRTAP1-1Q07627 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms