Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms