Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
IFITM3Q01628 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms