Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HOXC5Q00444 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms