Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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H3F3AP84243 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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H3F3AP84243 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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H3F3AP84243 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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H3F3AP84243 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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H3F3AP84243 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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H3F3AP84243 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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H3F3AP84243 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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H3F3AP84243 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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H3F3AP84243 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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H3F3AP84243 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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H3F3AP84243 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H3F3AP84243 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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