Protein–RNA interactions for Protein: P84085

ARF5, ADP-ribosylation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF5P84085 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF5P84085 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF5P84085 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF5P84085 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF5P84085 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF5P84085 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF5P84085 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF5P84085 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF5P84085 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF5P84085 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF5P84085 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF5P84085 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF5P84085 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF5P84085 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF5P84085 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF5P84085 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF5P84085 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF5P84085 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF5P84085 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF5P84085 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF5P84085 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF5P84085 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF5P84085 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF5P84085 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF5P84085 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF5P84085 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms