Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IRX1P78414 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX1P78414 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX1P78414 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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