Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HBBP68871 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HBBP68871 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HBBP68871 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms