Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TUBB4BP68371 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB4BP68371 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms