Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113P62684 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms