Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ERVS71-1P61550 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms