Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms