Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UBASH3AP57075 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBASH3AP57075 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms