Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SH3BGRP55822 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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