Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A2P55011 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC12A2P55011 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms