Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF135P52742 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms