Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA4P48058 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms