Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms