Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXA7P31268 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXA7P31268 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms