Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRB3P28472 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms