Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD10P28358 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms