Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HLA-DMAP28067 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms