Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHMLP26374 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHMLP26374 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHMLP26374 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHMLP26374 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHMLP26374 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHMLP26374 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHMLP26374 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHMLP26374 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHMLP26374 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHMLP26374 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHMLP26374 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHMLP26374 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHMLP26374 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHMLP26374 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHMLP26374 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHMLP26374 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHMLP26374 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHMLP26374 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHMLP26374 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHMLP26374 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHMLP26374 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHMLP26374 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHMLP26374 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHMLP26374 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHMLP26374 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHMLP26374 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHMLP26374 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHMLP26374 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHMLP26374 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHMLP26374 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHMLP26374 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHMLP26374 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHMLP26374 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHMLP26374 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHMLP26374 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHMLP26374 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHMLP26374 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHMLP26374 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHMLP26374 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHMLP26374 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHMLP26374 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHMLP26374 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHMLP26374 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHMLP26374 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHMLP26374 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHMLP26374 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHMLP26374 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHMLP26374 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHMLP26374 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHMLP26374 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHMLP26374 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHMLP26374 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHMLP26374 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHMLP26374 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHMLP26374 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHMLP26374 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHMLP26374 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHMLP26374 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHMLP26374 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHMLP26374 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms