Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPREP23469 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPREP23469 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPREP23469 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPREP23469 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPREP23469 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPREP23469 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPREP23469 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPREP23469 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPREP23469 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPREP23469 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPREP23469 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPREP23469 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPREP23469 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPREP23469 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPREP23469 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPREP23469 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPREP23469 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPREP23469 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPREP23469 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPREP23469 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPREP23469 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPREP23469 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPREP23469 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPREP23469 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPREP23469 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPREP23469 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPREP23469 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPREP23469 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPREP23469 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPREP23469 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPREP23469 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPREP23469 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPREP23469 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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