Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CD247P20963 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD247P20963 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD247P20963 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD247P20963 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD247P20963 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CD247P20963 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD247P20963 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD247P20963 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD247P20963 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD247P20963 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD247P20963 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CD247P20963 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CD247P20963 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CD247P20963 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms