Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NFKB1P19838 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NFKB1P19838 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NFKB1P19838 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NFKB1P19838 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NFKB1P19838 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NFKB1P19838 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NFKB1P19838 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NFKB1P19838 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NFKB1P19838 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NFKB1P19838 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NFKB1P19838 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NFKB1P19838 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NFKB1P19838 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NFKB1P19838 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NFKB1P19838 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NFKB1P19838 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NFKB1P19838 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NFKB1P19838 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NFKB1P19838 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NFKB1P19838 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NFKB1P19838 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
NFKB1P19838 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
NFKB1P19838 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
NFKB1P19838 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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NFKB1P19838 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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NFKB1P19838 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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NFKB1P19838 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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NFKB1P19838 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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NFKB1P19838 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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NFKB1P19838 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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NFKB1P19838 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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NFKB1P19838 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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NFKB1P19838 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NFKB1P19838 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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