Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRIM21P19474 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms