Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS1P17812 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTPS1P17812 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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