Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GOT1P17174 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GOT1P17174 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GOT1P17174 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GOT1P17174 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GOT1P17174 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GOT1P17174 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GOT1P17174 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GOT1P17174 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GOT1P17174 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GOT1P17174 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GOT1P17174 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GOT1P17174 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GOT1P17174 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GOT1P17174 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GOT1P17174 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GOT1P17174 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GOT1P17174 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GOT1P17174 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GOT1P17174 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GOT1P17174 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GOT1P17174 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GOT1P17174 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GOT1P17174 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GOT1P17174 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GOT1P17174 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GOT1P17174 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GOT1P17174 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GOT1P17174 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GOT1P17174 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GOT1P17174 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GOT1P17174 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GOT1P17174 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GOT1P17174 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GOT1P17174 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GOT1P17174 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GOT1P17174 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms