Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EPB42P16452 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EPB42P16452 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EPB42P16452 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EPB42P16452 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EPB42P16452 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EPB42P16452 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EPB42P16452 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EPB42P16452 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EPB42P16452 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EPB42P16452 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EPB42P16452 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EPB42P16452 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EPB42P16452 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EPB42P16452 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EPB42P16452 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EPB42P16452 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EPB42P16452 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EPB42P16452 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EPB42P16452 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EPB42P16452 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EPB42P16452 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EPB42P16452 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EPB42P16452 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
EPB42P16452 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EPB42P16452 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
EPB42P16452 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
EPB42P16452 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
EPB42P16452 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
EPB42P16452 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
EPB42P16452 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EPB42P16452 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
EPB42P16452 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EPB42P16452 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
EPB42P16452 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
EPB42P16452 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EPB42P16452 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EPB42P16452 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EPB42P16452 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EPB42P16452 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EPB42P16452 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EPB42P16452 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EPB42P16452 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EPB42P16452 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EPB42P16452 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms