Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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TNNT1P13805 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNNT1P13805 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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